水分平衡遭破坏病害侵染植物后,根系吸收能力下降;细胞透性增加,蒸腾失水加快;寄主产生的树胶、黏液等,堵塞导管。于是,水分吸收减少,失水增加。
呼吸作用加强一方面由于病原菌破坏细胞结构,酶与底物直接接触,氧化加快;另一方面,呼吸代谢途径由三羧酸循环转为磷酸戊糖途径,多酚氧化酶活性增强。
光合作用下降由于叶绿体结构遭破坏,叶绿素含量减少,CO2同化速率降低。
激素水平变化病原侵染后,某些激素水平明显升高,表现最明显的是生长素水平上升,其次是GA3下降。激素水平的变化导致形成肿瘤、偏上生长。